RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484683.1

RPRD1B-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RPRD1B, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-205ENST00000484683 ZIM3Q96PE6 472 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 BTBD9Q96Q07 612 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ADOQ96SZ5 270 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.51□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 GNB5O14775 395 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CBR3O75828 277 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 WISP2O76076 250 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 LRATO95237 230 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 IFI6P09912 130 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 COX6B1P14854 86 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 HPGDP15428 266 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 SDC1P18827 310 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PRPS1L1P21108 318 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PRKAG1P54619 331 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 STX3Q13277 289 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CPTPQ5TA50 214 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 AAGABQ6PD74 315 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 OR7G2Q8NG99 324 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 LRRC46Q96FV0 321 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 EGLN2Q96KS0 407 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 VSTM2LQ96N03 204 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 GNRHR2Q96P88 292 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CBLCQ9ULV8 474 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.5□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 AHRRA9YTQ3 701 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TMEM233B4DJY2 109 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 UPK1AO00322 258 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TBX19O60806 448 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ICOSLGO75144 302 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 UGT2B11O75310 529 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 KRT16P08779 473 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CT45A8P0DMV1 189 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CT45A9P0DMV2 189 aa8.49□□□□□ -1.05
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RPRD1B-205ENST00000484683 CREB1P16220 341 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TACR1P25103 407 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CHRNB4P30926 498 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 GABRA3P34903 492 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ETV4P43268 484 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 RFX3P48380 749 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 SLC1A6P48664 564 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TRPC1P48995 793 aa8.49□□□□□ -1.05
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RPRD1B-205ENST00000484683 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CORO7P57737 925 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 DUSP2Q05923 314 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PMPCAQ10713 525 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 DUSP8Q13202 625 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 TP53BP2Q13625 1128 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 RCAN2Q14206 197 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 SMU1Q2TAY7 513 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.49□□□□□ -1.05
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RPRD1B-205ENST00000484683 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.49□□□□□ -1.05
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RPRD1B-205ENST00000484683 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 OR2L13Q8N349 312 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.49□□□□□ -1.05
RPRD1B-205ENST00000484683 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.49□□□□□ -1.05
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