RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 ASB16Q96NS5 453 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 SCGB3A2Q96PL1 93 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 OR51I1Q9H343 314 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 SLC6A14Q9UN76 642 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 SOX14O95416 240 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 CD46P15529 392 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 SDHBP21912 280 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 EDNRAP25101 427 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 OR3A3P47888 321 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 OR3A2P47893 321 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 GALK2Q01415 458 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 MALLQ13021 153 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 DSG2Q14126 1118 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 CDRT4Q8N9R6 151 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 OR52P1PQ8NH57 321 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 TUBA1CQ9BQE3 449 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ACSL6Q9UKU0 697 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PPL8 197 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 FAAHO00519 579 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ACOX3O15254 700 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ETFAP13804 333 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 MAB21L1Q13394 359 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 C6orf141Q5SZD1 244 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 OPN5Q6U736 354 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 PLPP6Q8IY26 295 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 FANK1Q8TC84 345 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 GAREM1Q9H706 876 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 RDH8Q9NYR8 311 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 MYOGP15173 224 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 PGM2L1Q6PCE3 622 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 CARM1Q86X55 608 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 METTL25Q8N6Q8 603 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ITPAQ9BY32 194 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ACTRT3Q9BYD9 372 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-207ENST00000479054 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 RETP07949 1114 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 PDHA2P29803 388 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 DCDC1P59894 354 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 DCAF7P61962 342 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 XKRXQ6PP77 449 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 TMEM107Q6UX40 140 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 NETO1Q8TDF5 533 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SGTBQ96EQ0 304 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 PIP5K1AQ99755 562 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa12.9□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 METTL21EPA6NDL7 271 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 B4GALT3O60512 393 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 RLN1P04808 185 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SEC23BQ15437 767 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SLC15A4Q8N697 577 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 THEM6Q8WUY1 208 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 MS4A4EQ96PG1 132 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 LAMP5Q9UJQ1 280 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 NUP205Q92621 2012 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 HTR1AP08908 422 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 IRF2P14316 349 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 CCNOP22674 350 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 RPS26P62854 115 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 TMEM52BQ4KMG9 183 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 VTCN1Q7Z7D3 282 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ZSWIM9Q86XI8 627 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ZNF283Q8N7M2 679 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 OR52N2Q8NGI0 321 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 FAM129BQ96TA1 746 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 CST11Q9H112 138 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ANKRA2Q9H9E1 313 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 EFCAB7A8K855 629 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 ADAM8P78325 824 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 RFLNAQ6ZTI6 216 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 GALNT10Q86SR1 603 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 SFXN2Q96NB2 322 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 GPR78Q96P69 363 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 MALT1Q9UDY8 824 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-207ENST00000479054 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms