RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478423.6

NPHP4-208, Transcript of nephrocystin 4, human

TSL 2

Gene NPHP4, Length 4,467 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPHP4-208	ENST00000478423	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CBLL1	Q75N03	491 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CD6	P30203	668 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	XCR1	P46094	333 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SYPL1	Q16563	259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	RNF121	Q9H920	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	AREL1	O15033	823 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CSN2	P05814	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	FCER2	P06734	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	AHR	P35869	848 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ACVR1B	P36896	505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	TANK	Q92844	425 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	APC2	O95996	2303 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423		H3BNC9	293 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	LCK	P06239	509 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CDKN2C	P42773	168 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CBX5	P45973	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NCS1	P62166	190 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF559	Q9BR84	538 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	KIAA0513	O60268	411 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ACTC1	P68032	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ACTA1	P68133	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ADAM15	Q13444	863 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CCDC115	Q96NT0	180 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423		K7ESM1	405 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	GFRA2	O00451	464 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	YPEL5	P62699	121 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	KLHL31	Q9H511	634 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	PRKCA	P17252	672 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	NUDT1	P36639	197 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	UGT8	Q16880	541 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPHP4-208	ENST00000478423	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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