RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458938.2

U3.44-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 192 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.44-201ENST00000458938 CCNG1P51959 295 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PDX1P52945 283 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PNLIPRP2P54317 469 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 GFERP55789 205 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PRPS1P60891 318 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PPP1CAP62136 330 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SLC18A2Q05940 514 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SPOCK1Q08629 439 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ZNF844Q08AG5 666 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MGAT2Q10469 447 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 NFATC3Q12968 1075 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 CSHL1Q14406 222 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 HERC3Q15034 1050 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TMED2Q15363 201 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MED22Q15528 200 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 OR4D1Q15615 310 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TBCCQ15814 346 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ZIC1Q15915 447 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PDK4Q16654 411 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ISXQ2M1V0 245 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SGO1Q5FBB7 561 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ZNF766Q5HY98 468 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 RNFT1Q5M7Z0 435 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FIGNL1Q6PIW4 674 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FAM20CQ8IXL6 584 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ELP5Q8TE02 316 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 UBASH3BQ8TF42 649 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 LCN9Q8WX39 176 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ATL1Q8WXF7 558 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 NAT6Q93015 286 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ESAMQ96AP7 390 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MIB2Q96AX9 1013 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ZBTB9Q96C00 473 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MIEF2Q96C03 454 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 LINGO1Q96FE5 620 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PRRC1Q96M27 445 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 OR2A14Q96R47 310 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ATOH8Q96SQ7 321 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 INTS14Q96SY0 518 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SLC38A3Q99624 504 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MAP3K3Q99759 626 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 NTMT1Q9BV86 223 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ASPNQ9BXN1 380 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SPRY4Q9C004 299 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 DERL2Q9GZP9 239 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 RNF32Q9H0A6 362 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 CHST8Q9H2A9 424 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TMEM140Q9NV12 185 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 KCNK4Q9NYG8 393 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.4□□□□□ -1.87
U3.44-201ENST00000458938 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms