RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 WHRNQ9P202 907 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 XPR1Q9UBH6 696 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PHF11Q9UIL8 331 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.4□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEB16A2A368 324 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SHISA9B4DS77 424 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 E7EQL1 145 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ABCD4O14678 606 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PRAMEF4O60810 478 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 REM1O75628 298 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CSF3P09919 207 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35E2P0CK97 266 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FCGR2AP12318 317 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GPX3P22352 226 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GRK2P25098 689 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NR4A2P43354 598 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 VPS41P49754 854 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PDLIM4P50479 330 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FABP6P51161 128 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 RAP1GDS1P52306 607 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EFNA4P52798 201 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SLMAPQ14BN4 828 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 STK11Q15831 433 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 AWAT1Q58HT5 328 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MUC15Q8N387 334 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 RNF175Q8N4F7 328 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ESAMQ96AP7 390 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NXNL1Q96CM4 212 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TMCO6Q96DC7 493 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SOX7Q9BT81 388 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ITPAQ9BY32 194 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 A0A0A6YYJ9 748 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PR48 441 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OR2M5A3KFT3 312 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LRP5LA4QPB2 252 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TRIM77I1YAP6 450 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SCO2O43819 266 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ALX3O95076 343 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SCELO95171 688 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 ADAP00813 363 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 AHSGP02765 367 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 OPN1LWP04000 364 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 NR2F6P10588 404 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 COL6A2P12110 1019 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TPSB2P20231 275 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CD22P20273 847 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 IL11P20809 199 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PIK3R1P27986 724 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GABRB3P28472 473 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 GALNSP34059 522 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 HNMTP50135 292 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 CDK16Q00536 496 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 IRF8Q02556 426 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 LGALS3BPQ08380 585 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 KIF5AQ12840 1032 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 TPSAB1Q15661 275 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 SLC22A25Q6T423 547 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-222ENST00000449504 C4orf22Q6V702 233 aa6.38□□□□□ -1.39
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