RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SCN2B	O60939	215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	IL6	P05231	212 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CCL3	P10147	92 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	LCN1	P31025	176 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	S100A3	P33764	101 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	KRT20	P35900	424 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PRIM2	P49643	509 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TMCO6	Q96DC7	493 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GIMAP5	Q96F15	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GPR137	Q96N19	417 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	HHATL	Q9HCP6	504 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DEPP	Q9NTK1	212 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN2	O60636	221 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	NKX2-2	O95096	273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf47	O95873	294 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	IL12B	P29460	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PIGA	P37287	484 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	IDH3A	P50213	366 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	AQP5	P55064	265 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	WNT3	P56703	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CORO7	P57737	925 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	FBXW4	P57775	412 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	HBA1	P69905	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	KCNC4	Q03721	635 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	FOXO1	Q12778	655 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DECR1	Q16698	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	DIO2	Q92813	273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	HGD	Q93099	445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC115	Q96NT0	180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	STAC	Q99469	402 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CFLAR	O15519	480 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	REM1	O75628	298 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A3	O75751	556 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	KCNH1	O95259	989 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PGR	P06401	933 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MST1	P26927	711 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	CASP3	P42574	277 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEA8	P43361	318 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ATP4B	P51164	291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GPR85	P60893	370 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	STX1B	P61266	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	UFM1	P61960	85 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ2	P63252	427 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PMP22	Q01453	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	RBPJ	Q06330	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	NNAT	Q16517	81 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MIER2	Q8N344	545 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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