RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444712.5

SNX13-204, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 5

Gene SNX13, Length 2,018 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-204ENST00000444712 HTR1AP08908 422 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 ACP2P11117 423 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 HOXA6P31267 233 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 IFNGR2P38484 337 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 PDX1P52945 283 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 ID2Q02363 134 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 DUSP5Q16690 384 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 ZAR1LA6NP61 321 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 AP3D1O14617 1153 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 SEMA7AO75326 666 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 STX11O75558 287 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 TAS2R41P59536 307 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 ILKQ13418 452 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 SLC38A4Q969I6 547 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX13-204ENST00000444712 MUL1Q969V5 352 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNX13-204ENST00000444712 CTNSO60931 367 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX13-204ENST00000444712 GSTM3P21266 225 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 SLC5A2P31639 672 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX13-204ENST00000444712 ST3GAL3Q11203 375 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 GRM7Q14831 915 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX13-204ENST00000444712 NPTX1Q15818 432 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.64□□□□□ -0.07
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SNX13-204ENST00000444712 VRK2Q86Y07 508 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 MYDGFQ969H8 173 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 SH3D21A4FU49 640 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 ENO4A6NNW6 628 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 FOXS1O43638 330 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 GUSBP08236 651 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 PCMT1P22061 227 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 CHMP24386 653 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 CTSKP43235 329 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 GPLD1P80108 840 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 MGAT2Q10469 447 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 STX4Q12846 297 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 SLC13A2Q13183 592 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 TRAM2Q15035 370 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 SEC23BQ15437 767 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX13-204ENST00000444712 DCST2Q5T1A1 773 aa14.63□□□□□ -0.07
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