RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433165.6

CNKSR3-202, Transcript of CNKSR family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNKSR3, Length 2,347 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR3-202ENST00000433165 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 IFI44LQ53G44 452 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SGO1Q5FBB7 561 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FIBINQ8TAL6 211 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FANK1Q8TC84 345 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 HMGB4Q8WW32 186 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 WBP2Q969T9 261 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CIPCQ9C0C6 399 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 DLL4Q9NR61 685 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ACER3Q9NUN7 267 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 NPTNQ9Y639 398 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 G3V3Q6 166 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 M0R233 179 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PRMT3O60678 531 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TBL1XO60907 577 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 GJB3O75712 270 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 B3GALNT1O75752 331 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 NUDT7P0C024 238 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 POU2F1P14859 743 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 RHOQP17081 205 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PRPS1L1P21108 318 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ITPKAP23677 461 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 MPLP40238 635 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 XCR1P46094 333 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 DMWDQ09019 674 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TPBGQ13641 420 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ETFDHQ16134 617 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 UGT8Q16880 541 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 C12orf73Q69YU5 71 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 MZT2AQ6P582 158 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CHST9Q7L1S5 443 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ST8SIA2Q92186 375 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FCRL1Q96LA6 429 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 COQ10AQ96MF6 247 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 NPAS1Q99742 590 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 HPF1Q9NWY4 346 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 C1orf226A1L170 272 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SMIM30A4D0T7 59 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 GPR171O14626 319 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 GMDSO60547 372 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SLC19A2O60779 497 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 MMP20O60882 483 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 SOD1P00441 154 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 PDYNP01213 254 aa7.25□□□□□ -1.25
CNKSR3-202ENST00000433165 FGF2P09038 288 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms