RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 C12orf57Q99622 126 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MRC1P22897 1456 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 AHSA1O95433 338 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 GLP1RP43220 463 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 NFATC2Q13469 925 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FAM124AQ86V42 546 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FN3KQ9H479 309 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CNIH4Q9P003 139 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 DHDHQ9UQ10 334 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 AKR7A2O43488 359 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RAB3DO95716 219 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 EPHX1P07099 455 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 BDKRB2P30411 391 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PBX2P40425 430 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 NKX3-2P78367 333 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 DOC2AQ14183 400 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ALG10Q5BKT4 473 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 APOOLQ6UXV4 268 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR2M4Q96R27 311 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 GSX2Q9BZM3 304 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 INIPQ9NRY2 104 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ACOT7O00154 380 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PEX14O75381 377 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PRNPP04156 253 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 AMY2BP19961 511 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ZNF91Q05481 1191 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 POU4F2Q12837 409 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PTPRRQ15256 657 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RAB11BQ15907 218 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TP53I3Q53FA7 332 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CPZQ66K79 652 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ZNF425Q6IV72 752 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 LBX2Q6XYB7 198 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 GPR142Q7Z601 462 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 NRMQ8IXM6 262 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 M0R3H8 397 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FBXO45P0C2W1 286 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 S1PR1P21453 382 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TOR2AQ5JU69 321 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PXKQ7Z7A4 578 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms