RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF566Q969W8 418 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CD180Q99467 661 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ARHGDIGQ99819 225 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 FNDC11Q9BVV2 318 aa16.69■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 FSCN3Q9NQT6 498 aa16.68■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16.67■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 GPR68Q15743 365 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 INAVAQ3KP66 663 aa16.67■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 XAF1Q6GPH4 301 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.67■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 PARP8Q8N3A8 854 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 GPR151Q8TDV0 419 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PRRC1Q96M27 445 aa16.67■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 MAP4K2Q12851 820 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 DGCR6Q14129 220 aa16.66■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PMS2CLQ68D20 193 aa16.66■□□□□ 0.26
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