RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ACRP10323 421 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 GNSP15586 552 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP2R1BP30154 601 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 KLHL31Q9H511 634 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 DKK3Q9UBP4 350 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FGF18O76093 207 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 LIMS3P0CW19 117 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 LIMS4P0CW20 117 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ACADLP28330 430 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 POU4F3Q15319 338 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM107Q6UX40 140 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 VRK2Q86Y07 508 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.18■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PGRMC2O15173 223 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NDUFS4O43181 175 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 HOXD10P28358 340 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 RRM2BQ7LG56 351 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NXPE3Q969Y0 559 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ARRDC3Q96B67 414 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 UPRTQ96BW1 309 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 HIDE1A8MVS5 230 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 OR3A3P47888 321 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CDH11P55287 796 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 DUSP2Q05923 314 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FAPQ12884 760 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC27A4Q6P1M0 643 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 MORN4Q8NDC4 146 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 IRAK3Q9Y616 596 aa16.17■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA0355O15063 1070 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PCCBP05166 539 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ST8SIA6P61647 398 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 KLBQ86Z14 1044 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 OR8K5Q8NH50 307 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 LGR4Q9BXB1 951 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 A0A1W2PRQ8 180 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGEF9O43307 516 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FCER2P06734 321 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ACP2P11117 423 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 GAS1P54826 345 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CLDN2P57739 230 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SMIM11AP58511 58 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 KLHL22Q53GT1 634 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NUDT13Q86X67 352 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PIGKQ92643 395 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 COQ10AQ96MF6 247 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FUZQ9BT04 418 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PLXNA2O75051 1894 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 CXCL10P02778 98 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FUT5Q11128 374 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM163Q8TC26 289 aa16.16■□□□□ 0.18
SEPHS1-201ENST00000327347 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms