RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 SKP2Q13309 424 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CHI3L2Q15782 390 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DCAF10Q5QP82 559 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C18orf63Q68DL7 685 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SFRP1Q8N474 314 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SMPDL3AQ92484 453 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 AP3S1Q92572 193 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DPF1Q92782 380 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 EDAQ92838 391 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MUL1Q969V5 352 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NPY6RQ99463 290 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PAFAH2Q99487 392 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 VAT1Q99536 393 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NT5DC2Q9H857 520 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SSUH2Q9Y2M2 353 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 USP3Q9Y6I4 520 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0A6YYH2 397 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0J9YYE9 177 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A4D1N5 150 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A6NJ64 397 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 K7EP13 123 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NR5A2O00482 541 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PRODHO43272 600 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC28A2O43868 658 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FKTNO75072 461 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 C6orf47O95873 294 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IGF2P01344 180 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TRBC1P01850 177 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PNLIPP16233 465 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 GDNFP39905 211 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PRKXP51817 358 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RAP1BP61224 184 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FAM189BP81408 668 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SORDQ00796 357 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KRT33BQ14525 404 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MPEG1Q2M385 716 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MED27Q6P2C8 311 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 BIVMQ86UB2 503 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 VASH2Q86V25 355 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ARMC10Q8N2F6 343 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MCFD2Q8NI22 146 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PHYHIPQ92561 330 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MR1Q95460 341 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 Q96MT0 163 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SLC38A3Q99624 504 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 DCSTAMPQ9H295 470 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RNF122Q9H9V4 155 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CHST11Q9NPF2 352 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OPN4Q9UHM6 478 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 OSGIN1Q9UJX0 560 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 A0A075B6Q4 140 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SYT5O00445 386 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PDCD5O14737 125 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 SCN2BO60939 215 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 S1PR4O95977 384 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 HTR1AP08908 422 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 MYL9P24844 172 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CD96P40200 585 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 RFX2P48378 723 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 CLCN7P51798 805 aa4.69□□□□□ -1.66
CLVS1-201ENST00000325897 PRKAG1P54619 331 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms