RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266079.4

PRPF6-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF6, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6-201ENST00000266079 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 21.9
PRPF6-201ENST00000266079 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 GLTPQ9NZD2 209 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 HSPB11Q9Y547 144 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PRR19A6NJB7 356 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PLA2G10O15496 165 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 C1QCP02747 245 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 RPN2P04844 631 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SLC6A12P48065 614 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 HNMTP50135 292 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 IRF8Q02556 426 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 DOC2BQ14184 412 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ELOCQ15369 112 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TEAD4Q15561 434 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 OPALINQ96PE5 141 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 HHATLQ9HCP6 504 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 A6NCN8 305 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TSPAN9O75954 239 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TPPPO94811 219 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 FHP07954 510 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PCDH1Q08174 1060 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TATDN3Q17R31 274 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PTOV1Q86YD1 416 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SLC5A8Q8N695 610 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TPD52L3Q96J77 140 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ING3Q9NXR8 418 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ICKQ9UPZ9 632 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ALG5Q9Y673 324 aa11.89□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SPTBN2O15020 2390 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ISM1B1AKI9 464 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 CLIC1O00299 241 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 MANBAO00462 879 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PDGFAP04085 211 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 HHEXQ03014 270 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PLET1Q6UQ28 207 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 IQCHQ86VS3 1027 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SYT12Q8IV01 421 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 CCDC120Q96HB5 630 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ABCB9Q9NP78 766 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 GSAPA4D1B5 854 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 FABP12A6NFH5 140 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 TNFRSF11BO00300 401 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PIAS2O75928 621 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SCG5P05408 212 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 NPPBP16860 134 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.517e-7■■■□□ 18.2
PRPF6-201ENST00000266079 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 PPT2Q9UMR5 302 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.88□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 LINC00862A6NCI5 91 aa11.87□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.87□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 H7BY64 318 aa11.87□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 M0R129 80 aa11.87□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 SCO1O75880 301 aa11.87□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 OR7A10O76100 309 aa11.87□□□□□ -0.51
PRPF6-201ENST00000266079 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms