RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253122.9

SLC6A8-201, Transcript of solute carrier family 6 member 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A8, Length 3,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 CPOQ8IVL8 374 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 TMEM163Q8TC26 289 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 IFT27Q9BW83 186 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.01□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 C1GALT1Q9NS00 363 aa15□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 F8A1P23610 371 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 CD93Q9NPY3 652 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 BBS10Q8TAM1 723 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 NDC1Q9BTX1 674 aa14.99□□□□□ -0.01
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SLC6A8-201ENST00000253122 M6PRP20645 277 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 VIPR1P32241 457 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 AHRP35869 848 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC6A8-201ENST00000253122 GMFBP60983 142 aa14.99□□□□□ -0.01
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