RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 COX18Q8N8Q8 333 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 C11orf65Q8NCR3 313 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 HIPK4Q8NE63 616 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM19Q96HH6 336 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PIGUQ9H490 435 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM38AQ9H6F2 299 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 A4GALTQ9NPC4 353 aa24.18■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 A0A1W2PQ72 361 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ACOT8O14734 319 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 NKX2-2O95096 273 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CDK6Q00534 326 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 MYBPC3Q14896 1274 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 C1orf146Q5VVC0 180 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 HSDL2Q6YN16 418 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 FGF11Q92914 225 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 RUBCNLQ9H714 662 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 FBXO34Q9NWN3 711 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CACNA1AO00555 2505 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CXCR6O00574 342 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PCDH17O14917 1159 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ASNA1O43681 348 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CIB2O75838 187 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CHRM4P08173 479 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 NR2F1P10589 423 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 GGT1P19440 569 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PCGF2P35227 344 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 RFX3P48380 749 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 Q0VFX4 171 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 SPATS1Q496A3 300 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 FIGNL1Q6PIW4 674 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ASB9Q96DX5 294 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 BTBD9Q96Q07 612 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 SPATA9Q9BWV2 254 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 FAM117AQ9C073 453 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 DUSP22Q9NRW4 184 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.16■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 NKX2-8O15522 239 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ADRB1P08588 477 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PRKAR1AP10644 381 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CLCN2P51788 898 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 BNIP2Q12982 314 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 FXNQ16595 210 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 GPAT3Q53EU6 434 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PLAG1Q6DJT9 500 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 GLYATQ6IB77 296 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ERICH5Q6P6B1 374 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 PRR22Q8IZ63 422 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 STACQ99469 402 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 ELP5Q8TE02 316 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 KCNE4Q8WWG9 221 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 GIN1Q9NXP7 522 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 CFL2Q9Y281 166 aa24.15■■□□□ 1.46
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM200CA6NKL6 621 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 DUXAA6NLW8 204 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 OR6C76A6NM76 312 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 H6PDO95479 791 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 HPP00738 406 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 IGKV1D-16P01601 117 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 MAGEA8P43361 318 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 ST13P50502 369 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 FLOT2Q14254 428 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 EXT1Q16394 746 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 DCST2Q5T1A1 773 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 ZAR1Q86SH2 424 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 DHFR2Q86XF0 187 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF441Q8N8Z8 693 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 EXD2Q9NVH0 621 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 OR10H1Q9Y4A9 318 aa24.14■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 C5orf58C9J3I9 102 aa24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 PEX12O00623 359 aa24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 FCMRO60667 390 aa24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 ITGAMP11215 1152 aa24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 PPICP45877 212 aa24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 RBBP4Q09028 425 aa24.13■■□□□ 1.45
TOMM40-201ENST00000252487 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms