RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ZNF175Q9Y473 711 aa6.86□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FAM72CH0Y354 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NDUFB2O95178 105 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DLSTP36957 453 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ALDH3B2P48448 385 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HHEXQ03014 270 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HYAL2Q12891 473 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RGNQ15493 299 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SPATC1Q76KD6 591 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FAM72BQ86X60 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 AMBNQ9NP70 447 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 A8MVJ9 347 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 YKT6O15498 198 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CYB5BO43169 146 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HCRTO43612 131 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 APLNRP35414 380 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 OR1E2P47887 323 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MADCAM1Q13477 382 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GRIN2CQ14957 1233 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PON2Q15165 354 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SPHARQ15513 63 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NIPAL3Q6P499 406 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF366Q8N895 744 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MUS81Q96NY9 551 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CENPOQ9BU64 300 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CREBZFQ9NS37 354 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CD207Q9UJ71 328 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPW3 197 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 KIAA0513O60268 411 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GBAP04062 536 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ETFAP13804 333 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PRKACGP22612 351 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MAGEA6P43360 314 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ID2Q02363 134 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MEF2DQ14814 521 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 AWAT2Q6E213 333 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SLC43A2Q8N370 569 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 BORCS7Q96B45 105 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM68Q96MH6 324 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 F2RL3Q96RI0 385 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C4BP0C0L5 1744 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C2orf78A6NCI8 922 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SLC1A7O00341 560 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SOCS2O14508 198 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 UGT2B7P16662 529 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TNFSF4P23510 183 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CHMP24386 653 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DIO3P55073 304 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CARD17Q5XLA6 110 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM19Q96HH6 336 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NENFQ9UMX5 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 D6RAR5 112 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DIRAS1O95057 198 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PROS1P07225 676 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RAB3AP20336 220 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CAPN3P20807 821 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HOXA9P31269 272 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MC3RP41968 323 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MAP2K4P45985 399 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MLLT10P55197 1068 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 BCL2A1Q16548 175 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LNX2Q8N448 690 aa6.84□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RNF128Q8TEB7 428 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms