RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NRG3P56975 720 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 DEFA6Q01524 100 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TGM3Q08188 693 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SNTA1Q13424 505 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TGFBIQ15582 683 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM2Q9C040 744 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 DERL2Q9GZP9 239 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ALG2Q9H553 416 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 WHRNQ9P202 907 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TAPBPO15533 448 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1BO75688 479 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CD3EP07766 207 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PRR31Q5SQ13 230 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 KRT78Q8N1N4 520 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF525Q8N782 197 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 RIT1Q92963 219 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PINK1Q9BXM7 581 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF175Q9Y473 711 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 H0YC42 278 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC188H7C350 402 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CD22P20273 847 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GGT5P36269 586 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf54Q08AI8 447 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GPSM1Q86YR5 675 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TANKQ92844 425 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SNX24Q9Y343 169 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 B4DXG7 233 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0513O60268 411 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZIC3O60481 467 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF21O75509 655 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 AIFM1O95831 613 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PEPDP12955 493 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 EPORP19235 508 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CNTFP26441 200 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GALNSP34059 522 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 POU4F1Q01851 419 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF17Q02223 184 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 OR4D1Q15615 310 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C18orf63Q68DL7 685 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf56Q8N813 242 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FAM168AQ92567 244 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PROX1Q92786 737 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms