RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CAPGP40121 348 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 EMDP50402 254 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PMM1Q92871 262 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 WDR45Q9Y484 360 aa15.64■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TTC36A6NLP5 189 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FCMRO60667 390 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PRAMEF2O60811 474 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ALBP02768 609 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 LYNP07948 512 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GUSBP08236 651 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 HBQ1P09105 142 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CHN2P52757 468 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SPIBQ01892 262 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RHAGQ02094 409 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 DCST2Q5T1A1 773 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PHF19Q5T6S3 580 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 C1orf189Q5VU69 101 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 COX18Q8N8Q8 333 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GPR151Q8TDV0 419 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 POLE3Q9NRF9 147 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 C3orf18Q9UK00 162 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 KCND3Q9UK17 655 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 IFT52Q9Y366 437 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SPTBP11277 2137 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS20P59510 1910 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 HS6ST1O60243 411 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 STX11O75558 287 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 EPPINO95925 133 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ONECUT2O95948 504 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TNNI3P19429 210 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 MYF6P23409 242 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PRKAR1BP31321 381 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SSTR4P31391 388 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 GABRA3P34903 492 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RORAP35398 523 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 RAD23AP54725 363 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 KDM4DQ6B0I6 523 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CYP4Z1Q86W10 505 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CYGBQ8WWM9 190 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZG16BQ96DA0 208 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 VSTM2LQ96N03 204 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ACER3Q9NUN7 267 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.63■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 J3KTA2 159 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 SCRG1O75711 98 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FGF5P12034 268 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 LIMS1P48059 325 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 DAPP51397 102 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 CDH12P55289 794 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PSG6Q00889 435 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 BLMHQ13867 455 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 IL11RAQ14626 422 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 VWA2Q5GFL6 755 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 FAHD1Q6P587 224 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 USP51Q70EK9 711 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 COX15Q7KZN9 410 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 COMTD1Q86VU5 262 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.62■□□□□ 0.09
TVP23C-201ENST00000225576 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms