RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Metap1dQ9CPW9 335 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fbxo36Q9CQ24 188 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tubb3Q9ERD7 450 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 RoraP51448 523 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 St3gal1P54751 337 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prss43Q76HL1 382 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr290Q7TS13 315 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Steap3Q8CI59 488 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr307Q8VFN8 313 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa10.64□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Akap12Q9WTQ5 1684 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sh3yl1O08641 340 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NnmtO55239 264 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AldoaP05064 364 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GzmeP08884 248 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Esr1P19785 599 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 FurinP23188 793 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Siah1aP61092 282 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AbraclQ4KML4 81 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pithd1Q8BWR2 211 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Osbpl11Q8CI95 751 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dapl1Q9D757 107 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Clec3aQ9EPW4 196 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf518bB2RRE4 1077 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r84D3YWE3 849 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm45692D3Z0A0 150 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mrap2D3Z1Q2 207 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Btnl2O70355 454 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 EvlP70429 414 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Phlda1Q62392 405 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HjurpQ6PG16 667 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cept1Q8BGS7 416 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pars2Q8CFI5 475 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ces2cQ91WG0 561 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rab3bQ9CZT8 219 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TesclQ9DAJ7 231 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttc37F8VPK0 1563 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd300ld2A2A7W0 305 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Shisa8J3QNX5 399 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd14P10810 366 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Scg5P12961 212 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Opn1swP51491 346 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 DsppP97399 934 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trappc13Q3TIR1 417 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Xrra1Q3U3V8 786 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc25a51Q5HZI9 298 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Laptm5Q61168 261 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zer1Q80ZJ6 779 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MylipQ8BM54 445 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd209cQ91ZW9 178 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 9030624G23RikQ9D308 155 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mrpl17Q9D8P4 176 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Med27Q9DB40 311 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rfx5Q9JL61 658 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nme4Q9WV84 186 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Chd3B1AR17 2055 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 IghdA0A0A6YW14 291 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Enthd1E9Q1Z2 618 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp616J3QN14 987 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TyrP11344 533 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Actr1aP61164 376 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Il6stQ00560 917 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Emx2Q04744 253 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acss3Q14DH7 682 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp987Q32P14 633 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GapdhsQ64467 440 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stoml3Q6PE84 287 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rxfp3Q8BGE9 472 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm10330Q8BKS1 112 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r205Q8R276 316 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 SarafQ8R3Q0 334 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Actr1bQ8R5C5 376 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Edem1Q925U4 652 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fndc8Q9D2H8 321 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndst3Q9EQH7 873 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PolmQ9JIW4 496 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cped1B2RX70 1026 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm5901D3YVJ1 333 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr618K7N6B3 318 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HckP08103 524 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Polr2cP97760 275 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TefmQ5SSK3 364 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem164Q6PHN7 296 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem150cQ8C8S3 249 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr516Q8VFZ5 314 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rbm39Q8VH51 530 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 WacQ924H7 646 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Actl6bQ99MR0 426 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mzb1Q9D8I1 188 aa10.63□□□□□ -0.71
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GraspQ9JJA9 392 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.2 ms