RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 A0A0U1RQS6 177 aa19.15■□□□□ 0.66
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CTDP1-208ENST00000613122 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
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CTDP1-208ENST00000613122 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 KCNIP1Q9NZI2 227 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 ADAM12O43184 909 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 TDGQ13569 410 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 ENPP6Q6UWR7 440 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 GALNT11Q8NCW6 608 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 VN1R2Q8NFZ6 395 aa19.12■□□□□ 0.65
CTDP1-208ENST00000613122 DNTTIP1Q9H147 329 aa19.12■□□□□ 0.65
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