RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RIN1Q13671 783 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PROX2Q3B8N5 592 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GAREM2Q75VX8 874 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RNF130Q86XS8 419 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC15A4Q8N697 577 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ABCG5Q9H222 651 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NANOGQ9H9S0 305 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DEC1Q9P2X7 70 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 M0R2N6 131 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TO15178 435 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BMP2P12643 396 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BMI1P35226 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BRCC3P46736 316 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD8P48556 350 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GAL3ST1Q99999 423 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR51I1Q9H343 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GLB1P16278 677 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EVI2BP34910 448 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G16P53816 162 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NPRL3Q12980 569 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF74Q16587 644 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MUL1Q969V5 352 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD11Q96NU1 681 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GON7Q9BXV9 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TGM4P49221 684 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR68Q15743 365 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM63AO94886 807 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 APBB3O95704 486 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-DQB2P05538 268 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KLK1P06870 262 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MMP2P08253 660 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-DOBP13765 273 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TJP1Q07157 1748 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GALEQ14376 348 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP6Q5VW22 663 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BBS10Q8TAM1 723 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM46BQ96A09 425 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP4Q96P64 663 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HES2Q9Y543 173 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR6C74A6NCV1 312 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR7A17O14581 309 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 APOA2P02652 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADRB3P13945 408 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RAB5AP20339 215 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HTR3AP46098 478 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 STRADBQ9C0K7 418 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SCN4AP35499 1836 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 F5H5P2 479 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBPP20226 339 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF266Q14584 549 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PON2Q15165 354 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SPHARQ15513 63 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C22orf42Q6IC83 251 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms