RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590220.1

PIK3C3-213, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PJA2	O43164	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TUBB	P07437	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TPSB2	P20231	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	IL32	P24001	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRTN3	P24158	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PTAFR	P25105	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	NMBR	P28336	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	AGTR1	P30556	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC6A8	P48029	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	FABP6	P51161	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	NEK2	P51955	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PLA2G16	P53816	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GAS1	P54826	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	CLDN20	P56880	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	UBE2H	P62256	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	MYL5	Q02045	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	COL10A1	Q03692	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	RIN1	Q13671	783 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PPA1	Q15181	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GGN	Q86UU5	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	RIT1	Q92963	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	CITED1	Q99966	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220		M0QZ24	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	T	O15178	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SPOP	O43791	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	UGT2B11	O75310	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	VAPB	O95292	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	GPR75	O95800	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	BCL10	O95999	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIK3C3-213	ENST00000590220	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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