RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 NANOGQ9H9S0 305 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 POLE3Q9NRF9 147 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 STARD5Q9NSY2 213 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PISDQ9UG56 409 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 B4GALT2O60909 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 STK17BO94768 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TNFSF15O95150 251 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 KCNK5O95279 499 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C6orf47O95873 294 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SOAT1P35610 550 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FOLR3P41439 243 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR1D4P47884 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A2P52569 658 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 WNT3P56703 355 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 HBA1P69905 142 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 HPCAP84074 193 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A3Q00325 362 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ID3Q02535 119 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 HSPB3Q12988 150 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SSPNQ14714 243 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 NCF4Q15080 339 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 DHFR2Q86XF0 187 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RAB43Q86YS6 212 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR2L13Q8N349 312 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 OR8K3Q8NH51 312 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP90Q8TF47 636 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 FBXL20Q96IG2 436 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF607Q96SK3 696 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 STACQ99469 402 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 LPAR4Q99677 370 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CRB3Q9BUF7 120 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMAD4-210ENST00000590061 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SERHLQ9NQF3 203 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 GLOD5A6NK44 160 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 AQP12BA6NM10 295 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 IDSB3KWA1 339 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 PEX12O00623 359 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ACOX3O15254 700 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 HCRTR1O43613 425 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 ALOX12BO75342 701 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD4-210ENST00000590061 FKBP6O75344 327 aa6.83□□□□□ -1.32
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