RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 INAQ16352 499 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NTRK2Q16620 822 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 GFRALQ6UXV0 394 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SZRD1Q7Z422 152 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP43Q8NFH3 380 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2M7Q8NG81 312 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NR4A3Q92570 626 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 DIO2Q92813 273 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ERP27Q96DN0 273 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OMA1Q96E52 524 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SGCZQ96LD1 299 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMD6Q96NE9 622 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP26Q9BV47 211 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CLMPQ9H6B4 373 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 EQTNQ9NQ60 294 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ASIC5Q9NY37 505 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CNIH4Q9P003 139 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 FREM3P0C091 2139 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ASPDHA6ND91 283 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 FRG2CA6NGY1 282 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM166BA8MTA8 275 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF195O14628 629 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 HS6ST1O60243 411 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 COQ9O75208 318 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SLITRK5O94991 958 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf47O95873 294 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NAGAP17050 411 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 GABRA3P34903 492 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT20P35900 424 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CASP3P42574 277 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 RFX3P48380 749 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 TDGF1P3P51864 188 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 DGKQP52824 942 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNJ2P63252 427 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 PHC1P78364 1004 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 PSG6Q00889 435 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM198Q66K66 360 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 BICRALQ6AI39 1079 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 EPGNQ6UW88 154 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 MAVSQ7Z434 540 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC34A3Q8N130 599 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2L13Q8N349 312 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NATD1Q8N6N6 113 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR151Q8TDV0 419 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC9A6Q92581 669 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT2BQ93097 391 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 TMBIM1Q969X1 311 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-211ENST00000588374 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms