RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DEF8Q6ZN54 512 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TRILQ7L0X0 811 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OAFQ86UD1 273 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PDZD3Q86UT5 571 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM129CQ86XR2 697 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MORN4Q8NDC4 146 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC16Q8NEE8 873 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2L2Q8NH16 312 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RAET1EQ8TD07 263 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SNAPC3Q92966 411 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SCMH1Q96GD3 660 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GALT6Q96L58 329 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ATF6BQ99941 703 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR14Q9BWN1 585 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MS4A8Q9BY19 250 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP28Q9H239 520 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MED9Q9NWA0 146 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FKBP7Q9Y680 259 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5K3A6NET4 321 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 J3KTA2 159 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 HMGN4O00479 90 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GABRPO00591 440 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 AP3D1O14617 1153 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PLD2O14939 933 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX4O60224 188 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ICMTO60725 284 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL6IP5O75915 188 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 UBL3O95164 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCL10P02778 98 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LIMS3P0CW19 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 LIMS4P0CW20 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TYRP1P17643 537 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TNNI3P19429 210 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF1BP20333 461 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP11P24347 488 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TEAD1P28347 426 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CD70P32970 193 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MAN2A2P49641 1150 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FLT3LGP49771 235 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 GAS1P54826 345 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPRRQ15256 657 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MPEG1Q2M385 716 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CLLU1Q5K131 121 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ADCK2Q7Z695 626 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 CMIPQ8IY22 773 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 SYT14Q8NB59 555 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T33Q8NG76 320 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-202ENST00000586851 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms