RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 ADAM10O14672 748 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 MC3RP41968 323 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 CASP3P42574 277 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 MASP1P48740 699 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 MAN2A2P49641 1150 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 CORO7P57737 925 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 SLC34A3Q8N130 599 aa28.19■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 METTL7AQ9H8H3 244 aa28.19■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 KCNK9Q9NPC2 374 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 TAS2R9Q9NYW1 312 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa28.19■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 TMED5Q9Y3A6 229 aa28.19■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 HRH3Q9Y5N1 445 aa28.19■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 DCTP40126 519 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 NUP54Q7Z3B4 507 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 CROCCP2Q86T23 111 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 PACS2Q86VP3 889 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 OR5M9Q8NGP3 310 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 OR6Y1Q8NGX8 325 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 HGDQ93099 445 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 TMBIM1Q969X1 311 aa28.18■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 AMDHD1Q96NU7 426 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 DMRTA2Q96SC8 542 aa28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 COQ9O75208 318 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 HSPA4LO95757 839 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 MYZAPP0CAP1 466 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 ART3Q13508 389 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 CHI3L2Q15782 390 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 XKRXQ6PP77 449 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 PPCDCQ96CD2 204 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 NODALQ96S42 347 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 REEP4Q9H6H4 257 aa28.17■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 PNPLA3Q9NST1 481 aa28.17■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 TM9SF1O15321 606 aa28.16■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 SUSD5O60279 629 aa28.16■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 CT45A9P0DMV2 189 aa28.16■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 CT45A2Q5DJT8 189 aa28.16■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 XKR7Q5GH72 579 aa28.16■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 EMC4Q5J8M3 183 aa28.16■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 NPSR1Q6W5P4 371 aa28.16■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 HCN1O60741 890 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 ERLIN1O75477 346 aa28.15■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 TRPC1P48995 793 aa28.15■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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CMTM4-204ENST00000563952 COL21A1Q96P44 957 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 QPCTLQ9NXS2 382 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 KLRF1Q9NZS2 232 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 SH3BP4Q9P0V3 963 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 ACAD8Q9UKU7 415 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 OR10H1Q9Y4A9 318 aa28.15■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 PCNX1Q96RV3 2341 aa28.14■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 GNB5O14775 395 aa28.14■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 BIRC5O15392 142 aa28.14■■■□□ 2.1
CMTM4-204ENST00000563952 ITM2AO43736 263 aa28.14■■■□□ 2.1
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