RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 OMA1Q96E52 524 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 RADILQ96JH8 1075 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 F2RL3Q96RI0 385 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NODALQ96S42 347 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 C12orf49Q9H741 205 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 WDR41Q9HAD4 459 aa8.64□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 STOML1Q9UBI4 398 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.64□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 KRT20P35900 424 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 RAP1GDS1P52306 607 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 SLAMF1Q13291 335 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GUSBP1Q15486 140 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 STK11Q15831 433 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NDNQ99608 321 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 ZNF747Q9BV97 191 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 OR10A5Q9H207 317 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 NT5DC2Q9H857 520 aa8.63□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 41.6
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SMAD3-211ENST00000559460 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.63□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 ETS1P14921 441 aa8.62□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 HK1P19367 917 aa8.62□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.62□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.62□□□□□ -1.03
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SMAD3-211ENST00000559460 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 EHD3Q9NZN3 535 aa8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.61□□□□□ -1.03
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.61□□□□□ -1.03
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