RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LPAR1Q92633 364 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NRGNQ92686 78 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 P3H4Q92791 437 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PYCR2Q96C36 320 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MYEOVQ96EZ4 313 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR78Q96P69 363 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NDNQ99608 321 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CGREF1Q99674 301 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SRRQ9GZT4 340 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PHF11Q9UIL8 331 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 USP16Q9Y5T5 823 aa3.27□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1B0GW15 77 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 A1L4Q6 167 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HEPACAM2A8MVW5 462 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS46E5RG02 174 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 F8VVB4 439 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 F8VWA3 439 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX46H3BTG2 121 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 M0QZ24 198 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 AP4M1O00189 453 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CHUKO15111 745 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 B4GAT1O43505 415 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC28A2O43868 658 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CIAO1O76071 339 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 VNN1O95497 513 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GSRP00390 522 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CST4P01036 141 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TNNC2P02585 160 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ERBB2P04626 1255 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GPIP06744 558 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT16P08779 473 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ELFN1P0C7U0 828 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC35E2P0CK97 266 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 UQCRBP14927 111 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CPN1P15169 458 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CTRB1P17538 263 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ATF6P18850 670 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CD58P19256 250 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CNR1P21554 472 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFS1P28331 727 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LAP3P28838 519 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 STAT6P42226 847 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC1A2P43004 574 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NPBWR2P48146 333 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TGM4P49221 684 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ARF6P62330 175 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HERVK_113P63132 956 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ERVK-8P63133 956 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 IRF8Q02556 426 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GHRHRQ02643 423 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FPGSQ05932 587 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC18A2Q05940 514 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SNTA1Q13424 505 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MED21Q13503 144 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PEX6Q13608 980 aa3.26□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms