RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548401.1

LETMD1-216, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LETMD1, Length 433 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-216ENST00000548401 CD97P48960 835 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TRPC1P48995 793 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TP53BP2Q13625 1128 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 PIGGQ5H8A4 983 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DPP10Q8N608 796 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 NEURL3Q96EH8 262 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LMF1Q96S06 567 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 VPS4AQ9UN37 437 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.95■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 NDUFAB1O14561 156 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TO15178 435 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DRD5P21918 477 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 MAN2A2P49641 1150 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 PRKAG1P54619 331 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DCAF7P61962 342 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 MAPRE2Q15555 327 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 COQ5Q5HYK3 327 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 FBXO30Q8TB52 745 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC22A8Q8TCC7 542 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLAMF8Q9P0V8 285 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LHX6Q9UPM6 363 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 FXYD1O00168 92 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ANGPT2O15123 496 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ACOX3O15254 700 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DCTN3O75935 186 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 OR6B1O95007 311 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 NKX2-2O95096 273 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 WDPCPO95876 746 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SOX3P41225 446 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 PRIM2P49643 509 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SSR4P51571 173 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 MVDP53602 400 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TUBA3CQ13748 450 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DUSP5Q16690 384 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 REP15Q6BDI9 236 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 CDC73Q6P1J9 531 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 BHLHB9Q6PI77 547 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC15A4Q8N697 577 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZFP90Q8TF47 636 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 WBP1Q96G27 269 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC35G5Q96KT7 338 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 STMN3Q9NZ72 180 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 MAP10Q9P2G4 905 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 GMEB1Q9Y692 573 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 TTC36A6NLP5 189 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 CDK2AP1O14519 115 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 FBXO45P0C2W1 286 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ABCD3P28288 659 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 C6orf120Q7Z4R8 191 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 MDS2Q8NDY4 140 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ASB15Q8WXK1 588 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 HAS2Q92819 552 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-216ENST00000548401 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms