RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 OMA1Q96E52 524 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 MS4A8Q9BY19 250 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 TRIM2Q9C040 744 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 EHD1Q9H4M9 534 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 H0YC42 278 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 UGT2B11O75310 529 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 AIFM1O95831 613 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 TGFB1P01137 390 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PTNP21246 168 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GPX3P22352 226 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PGGT1BP53609 377 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CLDN15P56746 228 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 ACTG1P63261 375 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 HMGCS1Q01581 520 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 DOC2AQ14183 400 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 NNATQ16517 81 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 SGCBQ16585 318 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CR1LQ2VPA4 569 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 S100PBPQ96BU1 408 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 TMCO6Q96DC7 493 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 WDR41Q9HAD4 459 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 OARD1Q9Y530 152 aa9.1□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GLOD5A6NK44 160 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 AQP8O94778 261 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 AHSGP02765 367 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CSF3P09919 207 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CCDC175P0C221 793 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CT62P0C5K7 136 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 MLNP12872 115 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 EPB42P16452 691 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 IL11P20809 199 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GABRB3P28472 473 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 RAP1GDS1P52306 607 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 C21orf58P58505 322 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 BSPH1Q075Z2 132 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 KIF5AQ12840 1032 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CCNG2Q16589 344 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 BANPQ8N9N5 519 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 SNX31Q8N9S9 440 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 HSD17B8Q92506 261 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 HTRA1Q92743 480 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 RGMAQ96B86 450 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 HES6Q96HZ4 224 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 EHD3Q9NZN3 535 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 CFL2Q9Y281 166 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 VWA7Q9Y334 891 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.09□□□□□ -0.95
KDM5A-211ENST00000544777 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 H3BML4 177 aa9.08□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 LINC01387J3KSC0 135 aa9.08□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ACOX3O15254 700 aa9.08□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PRAMEF4O60810 478 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms