RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	UBD	O15205	165 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	EMC8	O43402	210 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PEX1	O43933	1283 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SCN2B	O60939	215 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	IDH3A	P50213	366 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PRR5	P85299	388 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PSG6	Q00889	435 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860		E9PBE3	544 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PPM1B	O75688	479 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860		P04436	131 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	IL6	P05231	212 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	EDN3	P14138	238 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GPC1	P35052	558 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	AQP5	P55064	265 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	WNT3	P56703	355 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	HSPB3	Q12988	150 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SNTA1	Q13424	505 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	RPS6KA2	Q15349	733 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	NR4A3	Q92570	626 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SLC35A4	Q96G79	324 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SLC22A3	O75751	556 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SNX4	O95219	450 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	CBX6	O95503	412 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	LCN1	P31025	176 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	S100A3	P33764	101 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PTGER1	P34995	402 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	UFM1	P61960	85 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PHC1	P78364	1004 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	GIMAP5	Q96F15	307 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ZBTB18	Q99592	522 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	TSPAN2	O60636	221 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	NKX2-2	O95096	273 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ADD1-223	ENST00000538860	PGR	P06401	933 aa		13.65	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms