RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH9	Q9ULB4	789 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FZR1	Q9UM11	496 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IFT52	Q9Y366	437 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PIK3C2B	O00750	1634 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SYNM	O15061	1565 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702		H3BMH7	237 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ARPC3	O15145	178 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF264	O43296	627 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN12	O43309	604 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1F1	O43749	312 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HPR	P00739	348 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	AGT	P01019	485 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNA1	P02708	482 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NR3C1	P04150	777 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TPM1	P09493	284 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC2A3	P11169	496 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GP1BB	P13224	206 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FNTA	P49354	379 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCR4	P51679	360 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OSTN	P61366	133 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	BTG1	P62324	171 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HERVK_113	P63132	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVK-8	P63133	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DMTN	Q08495	405 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAF2	Q12933	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GRB14	Q14449	540 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MEF2D	Q14814	521 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PARP6	Q2NL67	630 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL7A	Q4VC05	210 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ANO5	Q75V66	913 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	G2E3	Q7L622	706 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1328	Q86T90	577 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	VSTM4	Q8IW00	320 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX26	Q8N6G2	289 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SUSD6	Q92537	303 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ACCS	Q96QU6	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PSD2	Q9BQI7	771 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EXO5	Q9H790	373 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MED17	Q9NVC6	651 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HACD3	Q9P035	362 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		3.53	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MROH2A	A6NES4	1674 aa		3.52	□□□□□ -1.85
FAM49B-222	ENST00000522702	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		3.52	□□□□□ -1.85
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF1B	O60333	1816 aa		3.52	□□□□□ -1.85
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.52	□□□□□ -1.85
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		3.52	□□□□□ -1.85
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PPI3	338 aa		3.52	□□□□□ -1.85
FAM49B-222	ENST00000522702	HEATR9	A2RTY3	570 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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