RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 KIR2DL3P43628 341 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 PRKAA2P54646 552 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 TRIB1Q96RU8 372 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SH3GL2Q99962 352 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.5■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC151A5D8V7 595 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8RI6L899 631 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF136P52737 540 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 PKNOX1P55347 436 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 HMGCS1Q01581 520 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CEP112Q8N8E3 955 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 TMCO6Q96DC7 493 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ERP27Q96DN0 273 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 APIPQ96GX9 242 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 WDYHV1Q96HA8 205 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 FETUBQ9UGM5 382 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.49■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 C2orf72A6NCS6 295 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 OR6C70A6NIJ9 312 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CD8B2A6NJW9 211 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SYT5O00445 386 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ACTL6AO96019 429 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GSTA1P08263 222 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CD1EP15812 388 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 NAGLUP54802 743 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 RIPPLY3P57055 190 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 RCAN2Q14206 197 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 NRGNQ92686 78 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 TMBIM1Q969X1 311 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 COL21A1Q96P44 957 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 BTBD9Q96Q07 612 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 EBPLQ9BY08 206 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SERHLQ9NQF3 203 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CRIM1Q9NZV1 1036 aa22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ABCB7O75027 752 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CTAG2O75638 210 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ART1P52961 327 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CNPY4Q8N129 248 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 KIF18AQ8NI77 898 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 KAT2AQ92830 837 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35A4Q96G79 324 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 KCNA7Q96RP8 456 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SENP1Q9P0U3 644 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 TIMM22Q9Y584 194 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 HIVEP1P15822 2718 aa22.47■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 REM1O75628 298 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CBR3O75828 277 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 PYGBP11216 843 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 KRT20P35900 424 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GSTM5P46439 218 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 PSPHP78330 225 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SLC29A2Q14542 456 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 FLYWCH1Q4VC44 716 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GALNT18Q6P9A2 607 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 CALHM2Q9HA72 323 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 TBK1Q9UHD2 729 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 WIF1Q9Y5W5 379 aa22.46■■□□□ 1.19
ALYREF-203ENST00000511412 ERN1O75460 977 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ALYREF-203ENST00000511412 CYP4B1P13584 511 aa22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms