RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	DCTPP1	Q9H773	170 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	PIGV	Q9NUD9	493 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	COMMD8	Q9NX08	183 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		2.09	□□□□□ -2.07
USP34-222	ENST00000498268	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		2.09	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HIVEP2	P31629	2446 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	SYCE3	A1L190	88 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TLR4	O00206	839 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TSPAN2	O60636	221 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MMP10	P09238	476 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	LAMP1	P11279	417 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	UCP1	P25874	307 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TRIM23	P36406	574 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ZNF131	P52739	623 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MFAP2	P55001	183 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	SLC12A3	P55017	1021 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CCZ1B	P86790	482 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	EBI3	Q14213	229 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HFE	Q30201	348 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	EPC2	Q52LR7	807 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ACER2	Q5QJU3	275 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	APOOL	Q6UXV4	268 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	BNIPL	Q7Z465	357 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ARL14	Q8N4G2	192 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	LEMD2	Q8NC56	503 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	NEK11	Q8NG66	645 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MGARP	Q8TDB4	240 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ZNF721	Q8TF20	911 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	BIRC7	Q96CA5	298 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	DTD2	Q96FN9	168 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	GPR137	Q96N19	417 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	SPATA13	Q96N96	652 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	PRAM1	Q96QH2	718 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268		Q9HAA7	133 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MYO10	Q9HD67	2058 aa		2.08	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	EFCAB7	A8K855	629 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CHEK1	O14757	476 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CFLAR	O15519	480 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	VEGFD	O43915	354 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	SYNGR4	O95473	234 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CXCL14	O95715	111 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	NUDT14	O95848	222 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	SERPINF2	P08697	491 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ABHD2	P08910	425 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HLA-DPA1	P20036	260 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	NT5C2	P49902	561 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ARHGDIA	P52565	204 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	RAG2	P55895	527 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CBX3	Q13185	183 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	PPP2R5C	Q13362	524 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	SLC10A1	Q14973	349 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CARTPT	Q16568	116 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HAGH	Q16775	308 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HKDC1	Q2TB90	917 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	OTP	Q5XKR4	325 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	MOB2	Q70IA6	237 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	GPR142	Q7Z601	462 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		2.07	□□□□□ -2.08
USP34-222	ENST00000498268	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		2.07	□□□□□ -2.08

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