RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	LRIT2	A6NDA9	550 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC69	A6NI79	296 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615		E7ENQ6	273 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	TLR4	O00206	839 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	APBB3	O95704	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	IGFBP5	P24593	272 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	DRD3	P35462	400 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	ASAH1	Q13510	395 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	GPBP1	Q86WP2	473 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	P3H4	Q92791	437 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	NLN	Q9BYT8	704 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	LHX3	Q9UBR4	397 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CBWD5-231	ENST00000495615	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PDLIM1	O00151	329 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ABHD2	P08910	425 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	WNT2	P09544	360 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HOXB7	P09629	217 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	GNS	P15586	552 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HLA-DPA1	P20036	260 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PTPN4	P29074	926 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CHRNA3	P32297	505 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CCL11	P51671	97 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HAND2	P61296	217 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF85	Q03923	595 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF33B	Q06732	778 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF79	Q15937	498 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CABS1	Q96KC9	395 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PDF	Q9HBH1	243 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	MIOX	Q9UGB7	285 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FRG2C	A6NGY1	282 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HDAC3	O15379	428 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	NT5C2	P49902	561 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	UBXN1	Q04323	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OLFM4	Q6UX06	510 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	FNDC8	Q8TC99	324 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CARD9	Q9H257	536 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	PTPRU	Q92729	1446 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SYCE3	A1L190	88 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615		H0Y9J4	135 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	KERA	O60938	352 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LRP3	O75074	770 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	LYPD3	O95274	346 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	IGSF6	O95976	241 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ALPI	P09923	528 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SGSH	P51688	502 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	RAG2	P55895	527 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	HERVK_113	P63132	956 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	ERVK-8	P63133	956 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CBWD5-231	ENST00000495615	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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