RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf74	A8MZ97	194 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	P2RX6	O15547	441 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	B4GAT1	O43505	415 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RGS14	O43566	566 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	HCRTR1	O43613	425 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIAP1	O43715	76 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TBX19	O60806	448 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SDC3	O75056	442 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CBX6	O95503	412 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PRPS2	P11908	318 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	BCKDHA	P12694	445 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ST6GAL1	P15907	406 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MAG	P20916	626 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CALB2	P22676	271 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CHM	P24386	653 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CXCR2	P25025	360 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CMPK1	P30085	196 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PGM1	P36871	562 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DMTN	Q08495	405 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR68	Q15743	365 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SPIN4	Q56A73	249 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SPRED1	Q7Z699	444 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	OOSP2	Q86WS3	158 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DPP10	Q8N608	796 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TTL	Q8NG68	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	UBE2E3	Q969T4	207 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	REPS1	Q96D71	796 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MARK4	Q96L34	752 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CD180	Q99467	661 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DPH7	Q9BTV6	452 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIM4	Q9C037	500 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	SDK2	Q58EX2	2172 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	NIN	Q8N4C6	2090 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PQM1	296 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	FEZF1	A0PJY2	475 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717		F5H697	171 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	PEX11A	O75192	247 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	EED	O75530	441 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	TIPRL	O75663	272 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP5H	O75947	161 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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