RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403		P04436	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	MC3R	P41968	323 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PPIC	P45877	212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	EMD	P50402	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	CLDN8	P56748	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	C3AR1	Q16581	482 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM107	Q6UX40	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	DPY30	Q9C005	99 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ENO4	A6NNW6	628 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	TP53I11	O14683	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ACOX3	O15254	700 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PEX1	O43933	1283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	DRD5	P21918	477 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	EPHA3	P29320	983 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SOX18	P35713	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	DIO3	P55073	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	DUSP8	Q13202	625 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ART3	Q13508	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	NNAT	Q16517	81 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM64	Q6YI46	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ELP4	Q96EB1	424 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	GPR137	Q96N19	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	APC	P25054	2843 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403		A0A1W2PRB8	838 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	FRG2C	A6NGY1	282 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	IFI6	P09912	130 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	LAMP1	P11279	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	NAGA	P17050	411 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	CNR1	P21554	472 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	KRT20	P35900	424 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	MEOX1	P50221	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	CASP6	P55212	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	C21orf58	P58505	322 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	GPR85	P60893	370 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PSPH	P78330	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	RPS6KA2	Q15349	733 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24	2e-6	■□□□□ 10.2
NOP58-208	ENST00000488403	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	PRR22	Q8IZ63	422 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	OR2L13	Q8N349	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NOP58-208	ENST00000488403	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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