RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487932.5

PKD1-220, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1, Length 6,464 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-220ENST00000487932 TGM5O43548 720 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 SSX4O60224 188 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 GSRP00390 522 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C5AR1P21730 350 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 RGS6P49758 472 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TXNDC15Q96J42 360 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PCDH17O14917 1159 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CA3P07451 260 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 MSR1P21757 451 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 RAB31Q13636 194 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 GRIN2CQ14957 1233 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CDKN3Q16667 212 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ZNF404Q494X3 552 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.6□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ADH6P28332 368 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CD79BP40259 229 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PTH2RP49190 550 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ZXDBP98169 803 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.078e-7■■■■□ 20.6
PKD1-220ENST00000487932 UPP1Q16831 310 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CD34P28906 385 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CLDN2P57739 230 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ACTC1P68032 377 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ACTA1P68133 377 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 EPGNQ6UW88 154 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 MALSU1Q96EH3 234 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C17orf105B2RV13 164 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 AMY2AP04746 511 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PRKAR1BP31321 381 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 STT3AP46977 705 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 GALNT2Q10471 571 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ZBED5Q49AG3 693 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 Q6ZSR6 202 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ASRGL1Q7L266 308 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 IQCF3P0C7M6 154 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PBX2P40425 430 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TUBA3CQ13748 450 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PDSS2Q86YH6 399 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TMIEQ8NEW7 156 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 RSC1A1Q92681 617 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 GPR22Q99680 433 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 RNF38Q9H0F5 515 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 WDPCPO95876 746 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 MT-CO2P00403 227 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 FBXO45P0C2W1 286 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 CRHBPP24387 322 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 HRH2P25021 359 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 AQP2P41181 271 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 HTD2P86397 168 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 DYRK1AQ13627 763 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 TMEM205Q6UW68 189 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.59□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 DDCP20711 480 aa14.58□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PTAFRP25105 342 aa14.58□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 DIO3P55073 304 aa14.58□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 FUT2Q10981 343 aa14.58□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.58□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.58□□□□□ -0.07
PKD1-220ENST00000487932 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms