RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 GABRB1P18505 474 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 HOXD12P35452 270 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 XCR1P46094 333 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 GSTM5P46439 218 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 HMGA2P52926 109 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CDH12P55289 794 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM11AP58511 58 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CDK6Q00534 326 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 RHAGQ02094 409 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SYT16Q17RD7 645 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 MPEG1Q2M385 716 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 COLEC12Q5KU26 742 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SLC5A8Q8N695 610 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 RAB33BQ9H082 229 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.04□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GVT2 93 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 IRGMA1A4Y4 181 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ZAR1LA6NP61 321 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 C4orf51C9J302 202 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFS4O43181 175 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TBX1O43435 398 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 GADD45GO95257 159 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 EPHA2P29317 976 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 GSSP48637 474 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TPTEP56180 551 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 FOXK1P85037 733 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ST3GAL4Q11206 333 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF385BQ569K4 471 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 RNLSQ5VYX0 342 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 STEAP3Q658P3 488 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00471Q8N535 108 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 AMER3Q8N944 861 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 QRFPRQ96P65 431 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CTRCQ99895 268 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 NUAK2Q9H093 628 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ABCG4Q9H172 646 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL3Q9UH77 587 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 POMT2Q9UKY4 750 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 IFT52Q9Y366 437 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 ASB4Q9Y574 426 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.03□□□□□ -0.96
POLR1A-208ENST00000486964 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0J9YY10 115 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-208ENST00000486964 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-208ENST00000486964 B4DGG1 531 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-208ENST00000486964 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-208ENST00000486964 TMPRSS11DO60235 418 aa9.02□□□□□ -0.97
POLR1A-208ENST00000486964 GBAP04062 536 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms