RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
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PTPRD-211ENST00000486161 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRD-211ENST00000486161 CDS1Q92903 461 aa7.77□□□□□ -1.17
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PTPRD-211ENST00000486161 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.76□□□□□ -1.17
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PTPRD-211ENST00000486161 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK5O95279 499 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 BSGP35613 385 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RANBP1P43487 201 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
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