RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 FCARP24071 287 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ENPP2Q13822 863 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 NATD1Q8N6N6 113 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 Q96MT0 163 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SGPP1Q9BX95 441 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 EBF1Q9UH73 591 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 HCN2Q9UL51 889 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 JRKO75564 520 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CLPXO76031 633 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CSF2P04141 144 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PRG2P13727 222 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ST6GAL1P15907 406 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 AGXTP21549 392 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 MASP1P48740 699 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1D5P58170 312 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SELENOWP63302 87 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RBBP4Q09028 425 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC14A1Q13336 389 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GATA6Q92908 595 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 VCANP13611 3396 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 HTTP42858 3142 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1B0GW55 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PQF6 199 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ASPDHA6ND91 283 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 AGAP14A8MT82 685 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 YY2O15391 372 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CHST10O43529 356 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PAPLNO95428 1278 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PKLRP30613 574 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GPR4P46093 362 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM64Q6YI46 380 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ARL14Q8N4G2 192 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 EID2Q8N6I1 236 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RCBTB1Q8NDN9 531 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 C5orf34Q96MH7 638 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 UCK2Q9BZX2 261 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OCEL1Q9H607 264 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DUX4Q9UBX2 424 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP2K4P45985 399 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CPZQ66K79 652 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 RAB43Q86YS6 212 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR8H3Q8N146 312 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 FNDC8Q8TC99 324 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFP90Q8TF47 636 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ASB12Q8WXK4 309 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 CDS1Q92903 461 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 UCN3Q969E3 161 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 DIABLOQ9NR28 239 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 POT1Q9NUX5 634 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PR48 441 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SCO2O43819 266 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 EFEMP2O95967 443 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 RETP07949 1114 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1CAP62136 330 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 CHRNEQ04844 493 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 MAP4K2Q12851 820 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 SERPINA11Q86U17 422 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRVP-201ENST00000482597 VRK2Q86Y07 508 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms