RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NUDT8Q8WV74 236 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 HGDQ93099 445 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SH3GL2Q99962 352 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NUF2Q9BZD4 464 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MANSC1Q9H8J5 431 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 VIPAS39Q9H9C1 493 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ASIC5Q9NY37 505 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZNF835Q9Y2P0 537 aa19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 WIPF3A6NGB9 483 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 FAM166BA8MTA8 275 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 COQ9O75208 318 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ERN1O75460 977 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 LDLRP01130 860 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 IFI6P09912 130 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 HPCAL1P37235 193 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RBPJQ06330 500 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PLCXD2Q0VAA5 305 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 HSPB3Q12988 150 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 C1QL3Q5VWW1 255 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ATG16L1Q676U5 607 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 BICRALQ6AI39 1079 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DESI1Q6ICB0 168 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RGS9BPQ6ZS82 235 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A16Q86VW1 577 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SPPL2CQ8IUH8 684 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RIMKLAQ8IXN7 391 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SLC34A3Q8N130 599 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TMEM251Q8N6I4 163 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 OR7A2PQ8NGA2 310 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SSC4DQ8WTU2 575 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DIO2Q92813 273 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RELTQ969Z4 430 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NTNG2Q96CW9 530 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 OMA1Q96E52 524 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MAGED4Q96JG8 741 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DEFB127Q9H1M4 99 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PLSCR2Q9NRY7 297 aa19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SLC19A2O60779 497 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 LAMP1P11279 417 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 G6PDP11413 515 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RPL3P39023 403 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MANFP55145 182 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ2P63252 427 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 OCRLQ01968 901 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NUP54Q7Z3B4 507 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TRIM42Q8IWZ5 723 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL4Q9BY76 406 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MEAF6Q9HAF1 191 aa19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUH1 482 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 LRRC3CA6NJW4 275 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ACOT7O00154 380 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CASP3P42574 277 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CA7P43166 264 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CDK9P50750 372 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DIO3P55073 304 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PSG6Q00889 435 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TBCELQ5QJ74 424 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZFP28Q8NHY6 868 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TMBIM1Q969X1 311 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 COQ8BQ96D53 544 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NODALQ96S42 347 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DOHHQ9BU89 302 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZFP64Q9NPA5 681 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GTH9 108 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 KLF11O14901 512 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.679e-7■■■□□ 18.5
ACTB-211ENST00000480301 UGT2B11O75310 529 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PDE9AO76083 593 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RFPL3SP0C7P2 107 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 DDX5P17844 614 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PRPS1L1P21108 318 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA5P43359 124 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CLDN8P56748 225 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 C21orf58P58505 322 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RPP38P78345 283 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 MLC1Q15049 377 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 C3AR1Q16581 482 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 CPTPQ5TA50 214 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 TMEM81Q6P7N7 255 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 FJX1Q86VR8 437 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 LRRC34Q8IZ02 419 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 FAM109AQ8N4B1 249 aa19.21■□□□□ 0.67
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