RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 ITGADQ13349 1161 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ILKQ13418 452 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CCINQ13939 588 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 KIR2DS3Q14952 304 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NR1D2Q14995 579 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CEBPEQ15744 281 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 EOGTQ5NDL2 527 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CCNJQ5T5M9 372 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB119Q8N690 84 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NT5CQ8TCD5 201 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SFXN5Q8TD22 340 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ARSGQ96EG1 525 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 OR51E2Q9H255 320 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.33□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 A0A0G2JPF8 293 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 AIREO43918 545 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CKMT1AP12532 417 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TNFRSF17Q02223 184 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TGM3Q08188 693 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MAP4K2Q12851 820 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MED22Q15528 200 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ADCK1Q86TW2 530 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MORN4Q8NDC4 146 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SMIM10Q96HG1 83 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CLN6Q9NWW5 311 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DAPP1Q9UN19 280 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CFAP54Q96N23 3096 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PRQ8 180 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 AGRPO00253 132 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TNFRSF10CO14798 259 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TNFSF14O43557 240 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PRKYO43930 277 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TNFP01375 233 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 IGFBP4P22692 258 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 IFITM3Q01628 133 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 IRF3Q14653 427 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SLC6A18Q96N87 628 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PHOX2BQ99453 314 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 GPR174Q9BXC1 333 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 DSN1Q9H410 356 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.32□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 LRP4O75096 1905 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 A0A087WUU8 490 aa8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CDHR3-211ENST00000478080 B3GALT2O43825 422 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms