RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	IRAK3	Q9Y616	596 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	AUP1	Q9Y679	476 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NCAPD3	P42695	1498 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FEZF1	A0PJY2	475 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	C17orf100	A8MU93	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	HHLA1	C9JL84	531 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398		M0QZ24	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LAT	O43561	262 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RCBTB2	O95199	551 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	STBD1	O95210	358 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TDP2	O95551	362 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NDUFB10	O96000	172 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CETP	P11597	493 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	BMP3	P12645	472 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	HTR2A	P28223	471 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SSTR2	P30874	369 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PHB	P35232	272 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GNPDA1	P46926	289 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CCR6	P51684	374 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MVD	P53602	400 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	UBE2K	P61086	200 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	HERVK_113	P63132	956 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ERVK-25	P63136	954 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LCN2	P80188	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	E2F1	Q01094	437 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGEF7	Q14155	803 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NFATC4	Q14934	902 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RAB39A	Q14964	217 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TRIP10	Q15642	601 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	COX19	Q49B96	90 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RNF43	Q68DV7	783 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TXNDC8	Q6A555	127 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	RRM2B	Q7LG56	351 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	LYG2	Q86SG7	212 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	STH	Q8IWL8	128 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NUP43	Q8NFH3	380 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PANK1	Q8TE04	598 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	AGAP11	Q8TF27	550 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FAR1	Q8WVX9	515 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GLG1	Q92896	1179 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PSMG2	Q969U7	264 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SNX18	Q96RF0	628 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	NPAS1	Q99742	590 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MAP3K3	Q99759	626 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	SYT11	Q9BT88	431 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GAN	Q9H2C0	597 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	THSD1	Q9NS62	852 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TTC3-214	ENST00000472398	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.02	□□□□□ -1.93

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