RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM114	B3SHH9	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ACOX3	O15254	700 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PPM1B	O75688	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SDC1	P18827	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK1	P28482	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB5	P36952	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PPIC	P45877	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	RFX3	P48380	749 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	EMD	P50402	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PRKAG1	P54619	331 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CORO7	P57737	925 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FOXO1	Q12778	655 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CCT7	Q99832	543 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SSR4-208	ENST00000471880	FRG2C	A6NGY1	282 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TM9SF1	O15321	606 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ITM2A	O43736	263 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZWINT	O95229	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINE1	P05121	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	FGF4	P08620	206 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	BGN	P21810	368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	DRD5	P21918	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PRPH2	P23942	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HPCAL1	P37235	193 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ETV4	P43268	484 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880		E9PLN8	166 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	PLOD3	O60568	738 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2B11	O75310	529 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	SNX4	O95219	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	BCKDHA	P12694	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ARRB2	P32121	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	CASP3	P42574	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ASMT	P46597	345 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	GXYLT1	Q4G148	440 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SSR4-208	ENST00000471880	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	8e-13	■■■■□ 22.2
SSR4-208	ENST00000471880	TRIL	Q7L0X0	811 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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