RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	IGFALS	P35858	605 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	BNC1	Q01954	994 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	SGCG	Q13326	291 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	SNAPC1	Q16533	368 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL22	Q53GT1	634 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	USP30	Q70CQ3	517 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM163	Q8TC26	289 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ASB15	Q8WXK1	588 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ELP4	Q96EB1	424 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	WDFY2	Q96P53	400 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf42	Q9H799	3197 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	CYP7B1	O75881	506 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	MPI	P34949	423 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	MC3R	P41968	323 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	RAB8A	P61006	207 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC32	Q14392	662 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	AKAP14	Q86UN6	197 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	NUP43	Q8NFH3	380 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	DIO2	Q92813	273 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	PRR14	Q9BWN1	585 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	WBP1L	Q9NX94	342 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	LIPT1	Q9Y234	373 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058		V9GYH0	126 aa		15.9	■□□□□ 0.14
TOM1-210	ENST00000449058	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	PRODH	O43272	600 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ALPP	P05187	535 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ACP2	P11117	423 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	CMPK1	P30085	196 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R41	P59536	307 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	PSPH	P78330	225 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNE	Q04844	493 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	RAB40B	Q12829	278 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TSPAN31	Q12999	210 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TRAM2	Q15035	370 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ZG16B	Q96DA0	208 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQU0	124 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	IRGM	A1A4Y4	181 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	PRR23A	A6NEV1	266 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	FAM170B	A6NMN3	283 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	UBXN7	O94888	489 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	IFNGR2	P38484	337 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	VRK2	Q86Y07	508 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	GJD3	Q8N144	294 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	GPR151	Q8TDV0	419 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	GIMAP5	Q96F15	307 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ABHD8	Q96I13	439 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	OR2A14	Q96R47	310 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	CALML5	Q9NZT1	146 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SNX7	Q9UNH6	387 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		15.89	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM129	A0AVI4	362 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	STK25	O00506	426 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	IL1A	P01583	271 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	APOA1	P02647	267 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	ASGR2	P07307	311 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	WNT4	P56705	351 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	TGM3	Q08188	693 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	NELL2	Q99435	816 aa		15.88	■□□□□ 0.13
TOM1-210	ENST00000449058	APOO	Q9BUR5	198 aa		15.88	■□□□□ 0.13

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