RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 SGPP1Q9BX95 441 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF221Q9UK13 617 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 A8MV72 311 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SGK494L7N484 410 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HPGDP15428 266 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF12P17014 697 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ACADLP28330 430 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CRISP1P54107 249 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C1DQ13901 141 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 VEZF1Q14119 521 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ADPRMQ3LIE5 342 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LAIR1Q6GTX8 287 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC120Q96HB5 630 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 RIPOR3Q96MK2 946 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PCBD2Q9H0N5 130 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MVB12BQ9H7P6 319 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PR48 441 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FUOMA2VDF0 154 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PAPLNO95428 1278 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LIPAP38571 399 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MTAPQ13126 283 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP6Q16828 381 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF793Q6ZN11 406 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6ZS52 159 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 USP53Q70EK8 1073 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TBC1D15Q8TC07 691 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC38A4Q969I6 547 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FCMRO60667 390 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HTR1AP08908 422 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CHMP24386 653 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TGM4P49221 684 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ADPRHP54922 357 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNC4Q03721 635 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SPANXN2Q5MJ10 180 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PJA1Q8NG27 643 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GGHQ92820 318 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ITPAQ9BY32 194 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR45Q9Y484 360 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 DOCK8Q8NF50 2099 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SPEGQ15772 3267 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PPK0 400 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRTM2O43300 516 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CEACAM5P06731 702 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 NR4A2P43354 598 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FADDQ13158 208 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL7AQ4VC05 210 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PXDC1Q5TGL8 231 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM4DQ6B0I6 523 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SYCE2Q6PIF2 218 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2L3Q8NG85 312 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8H1Q8NGG4 311 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CDS1Q92903 461 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LRR1Q96L50 414 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR92Q96MX6 357 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 TSSK6Q9BXA6 273 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 B3GALT2O43825 422 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KHKP50053 298 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1CAP62136 330 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 BHLHB9Q6PI77 547 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS41Q7RTY9 318 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2A1Q8NGT9 310 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MSANTD3Q96H12 275 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GAL3ST4Q96RP7 486 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MCHR1Q99705 422 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C1GALT1Q9NS00 363 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 FAIMQ9NVQ4 179 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MLXQ9UH92 298 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C12orf71A8MTZ7 269 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 C2orf74A8MZ97 194 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00271P0C7V0 271 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX6P35712 828 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 GNA13Q14344 377 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 XAF1Q6GPH4 301 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 PODNL1Q6PEZ8 512 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4N4Q8N0Y3 316 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms