RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 WBP1Q96G27 269 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RERGLQ9H628 205 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 KIF25Q9UIL4 384 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 FZD4Q9ULV1 537 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 OARD1Q9Y530 152 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-205ENST00000436404 SCN2BO60939 215 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TIMP2P16035 220 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 DRD1P21728 446 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 MC4RP32245 332 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 IFI44LQ53G44 452 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 HGDQ93099 445 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ARRDC3Q96B67 414 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PDXPQ96GD0 296 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 SCMH1Q96GD3 660 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 RADILQ96JH8 1075 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 GABRG3Q99928 467 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CHST8Q9H2A9 424 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 GHITMQ9H3K2 345 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ASB4Q9Y574 426 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TLR4O00206 839 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 NPC1O15118 1278 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 EPB42P16452 691 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PRPS1L1P21108 318 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 F8A1P23610 371 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 POU1F1P28069 291 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PCGF2P35227 344 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 WNT3P56703 355 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CCINQ13939 588 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 GPR176Q14439 515 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PLK5Q496M5 336 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PLA1AQ53H76 456 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CD276Q5ZPR3 534 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 NXPE2Q96DL1 559 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 IL17CQ9P0M4 197 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 SPINT1O43278 529 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CLDN7O95471 211 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PRNPP04156 253 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PROS1P07225 676 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 SSTR2P30874 369 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 PTGER3P43115 390 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 OR1E2P47887 323 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC32Q14392 662 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TEAD4Q15561 434 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 FAM3CQ92520 227 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TM9SF4Q92544 642 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 MAL2Q969L2 176 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 REG4Q9BYZ8 158 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM168Q9H0V1 697 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ABCG8Q9H221 673 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 THSD1Q9NS62 852 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 ACER3Q9NUN7 267 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 STK25O00506 426 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CLDN9O95484 217 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 LIMS1P48059 325 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 HMGA2P52926 109 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 CAV3P56539 151 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 LDAHQ9H6V9 325 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-205ENST00000436404 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms