RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR7G2Q8NG99 324 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF675Q8TD23 568 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ITFG2Q969R8 447 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MVB12AQ96EY5 273 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NRBF2Q96F24 287 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C7orf34Q96L11 122 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RDH12Q96NR8 316 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR7D2Q96RA2 312 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NDC1Q9BTX1 674 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 BTBD2Q9BX70 525 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EQTNQ9NQ60 294 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 BATF3Q9NR55 127 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CUTCQ9NTM9 273 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GIN1Q9NXP7 522 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 USE1Q9NZ43 259 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SCOCQ9UIL1 159 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 AK5Q9Y6K8 562 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PROB1E7EW31 1015 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 H0YAE9 185 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TNFRSF11BO00300 401 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHGA12O60330 932 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 COQ9O75208 318 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MFN2O95140 757 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 IFNW1P05000 195 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FESP07332 822 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ALOX5P09917 674 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 THRBP10828 461 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FOLR1P15328 257 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FPR1P21462 350 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 AVPR2P30518 371 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CSF2RBP32927 897 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DCTP40126 519 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 XCR1P46094 333 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KCNJ5P48544 419 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MAN2A2P49641 1150 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CHN2P52757 468 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CRYBA2P53672 197 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RAD23AP54725 363 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SMIM11AP58511 58 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CCL7P80098 99 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 VLDLRP98155 873 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MAP4K2Q12851 820 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MERTKQ12866 999 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SERTAD2Q14140 314 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GK3PQ14409 553 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KCNAB1Q14722 419 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ANGPT1Q15389 498 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SYPL1Q16563 259 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TTC23Q5W5X9 447 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SMYD1Q8NB12 490 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR1L3Q8NH93 324 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CYGBQ8WWM9 190 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC9A6Q92581 669 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TFAP2CQ92754 450 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GIMAP5Q96F15 307 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PEX11GQ96HA9 241 aa6.2□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LOXL4Q96JB6 756 aa6.2□□□□□ -1.42
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