RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391218.1

RNU6-1250P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1250, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1250P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MRFAP1Q9Y605 127 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CLIC4Q9Y696 253 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 A0A1B0GVX0 72 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 A0A1W2PPM0 123 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM223A0PJW6 202 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ERICH4A6NGS2 130 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF724A8MTY0 619 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 E7EVH7 732 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 H3BMH7 237 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FXYD1O00168 92 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ATP2A1O14983 1001 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AREL1O15033 823 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SIVA1O15304 175 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RAD51BO15315 384 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC7A4O43246 635 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HCRTR1O43613 425 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TSPAN6O43657 245 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PDE8AO60658 829 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HCN1O60741 890 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SUPT3HO75486 399 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MFN2O95140 757 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 H6PDO95479 791 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IGHV3-48P01763 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IGHV3-9P01782 118 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HEXAP06865 529 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCDC159P0C7I6 412 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR8U8P0C7N1 319 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CT45A10P0DMU9 189 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MYL4P12829 197 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IL7RP16871 459 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CYP11B2P19099 503 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CD27P26842 260 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 POU1F1P28069 291 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ABCD3P28288 659 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPP2R1BP30154 601 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCR7P32248 378 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPM1AP35813 382 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CPOXP36551 454 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MAP2K4P45985 399 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GABRB2P47870 512 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UBE2AP49459 152 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UBE2E1P51965 193 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MFAP2P55001 183 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 EVCP57679 992 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PTENP60484 403 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPP2R2BQ00005 443 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF92Q03936 586 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RBBP4Q09028 425 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LMOD3Q0VAK6 560 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAPQ12884 760 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RIPK1Q13546 671 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ARFRP1Q13795 201 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 VGLL4Q14135 290 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MORC3Q14149 939 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MVPQ14764 893 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GUSBP1Q15486 140 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TAF11Q15544 211 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF77Q15935 545 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TBRG1Q3YBR2 411 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IGSF11Q5DX21 431 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ELFN2Q5R3F8 820 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CASC10Q5T4H9 136 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PLBD1Q6P4A8 553 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C6orf89Q6UWU4 347 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM47EQ6ZV65 393 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 Q6ZVQ6 151 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CYS1Q717R9 158 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TCF23Q7RTU1 214 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPP1R27Q86WC6 154 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 COMMD2Q86X83 199 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CKAP2LQ8IYA6 745 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ELMOD1Q8N336 334 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C10orf126Q8N4M7 172 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TMEM252Q8N6L7 170 aa-0.83□□□□□ -2.54
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